Les collections pédagogiques du lycée couvrent une période large du 16e siècle à nos jours dans de nombreuses disciplines : physique-chimie, sciences naturelles, arts plastiques, histoire-géographie, philosophie et littérature.
Ces collections sont conservées dans la salle Hébert, dans les salles de collection des sciences physiques et des sciences naturelles, dans les caves pour les plâtres ainsi que dans la bibliothèque aménagée dans les locaux de l’association.
Un inventaire des instruments scientifiques a été réalisé par l’Amélycor, en partenariat avec l’A.S.E.I.S.T.E. (Association de Sauvegarde et d’Étude des Instruments Scientifiques et Techniques de l’Enseignement). Ainsi, depuis 2012, 330 instruments sont visibles sur le site internet de l’A.S.E.I.S.T.E., parmi lesquels 72 figurent dans l’Encyclopédie des instruments de l’enseignement de la physique du XVIIIe au milieu du XXe siècle, publiée sous la direction de Francis Gire en 2016. Un premier inventaire des moulages en plâtre du lycée a été effectué en 2012. Enfin, 6 000 ouvrages ont été inventoriés et sont répertoriés dans les catalogues de la bibliothèque de Rennes Métropole et du fonds régional des bibliothèques.
La plupart des instruments et des objets ont été remis en état par l’Amélycor et par plusieurs générations successives de lycéens. Mais de nombreux spécialistes sont intervenus à divers reprises pour identifier et conseiller quant à la restauration des collections. Paolo Brenni (chercheur au CNR, Italie ; président de la Commission internationale des instruments scientifiques et spécialiste européen de ces instruments) a aidé à l’identification de nombreux appareils et prodigué des conseils pour l’entretien et la restauration de ces derniers. Philippe Cibard (Espace Ferrié, Musée des transmissions à Rennes) a restauré la machine de Morin et la machine électrique de Wimshurst (Ducretet & Lejeune). Ann Cloarec, a restauré la reliure d’un des volumes de planches de l’Encyclopédie de Diderot et d’Alembert et du cours manuscrit de philosophie de Robert (pris en notes par les élèves en 1879-1880). Sarah Toulouse (directrice adjointe de la bibliothèque de Rennes Métropole) a prodigué des conseils pour inventorier au mieux le fonds ancien de la bibliothèque.
